G+C
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미생물의 유전체 (genome)은 DNA로 되어 있습니다. 그리고, DNA는 A,C,G,T의 네 개의 염기로 구성되어 있고, A와T, 그리고 C와G는 각각 수소 결합을 하여 DNA의 이중나선 구조를 형성하게 됩니다. DNA중 G+C의 molar ratio는 미생물마다 다르며, 이는 중요한 분류학적 키로 적용될 수 있습니다. G+C의 molar ratio를 구하는 방법으로 크게 HPLC를 이용하는 법과 thermal denaturation을 이용하는 법이 있습니다. HPLC 법은 DNA를 P1 nuclease를 이용해서 monomer (nucleotide)로 분해한 후 이들 각각의 상대적 양을 HPLC를 이용해서 측정합니다. Thermal denaturation법은 DNA가 고온에서 나선구조가 풀리면서 single strand로 되는 온도가 G+C ratio에 비례하는 점에 착안한 방법입니다. (주)마이크로아이디에서는 Thermal denaturation 방법에 의한 G+C ratio (또는 DNA base composition)을 서비스합니다. G+C ratio는 동정에 필수적인 자료는 아니지만, 새로운 종을 발표해야 경우에는 반드시 필요한 자료입니다. |
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